根据《国家重点实验室建设管理暂行办法》的有关规定，研究所设研究所主任1名，副主任2名。研究所主任应是本领域高水平的学术、学科带头人，具有较强的组织管理和协调能力，年龄一般不超过六十岁，任期为五年。研究所主任由北京信息科技大学研究生院推荐、聘任。副主任由主任提名，北京信息科技大学数据恢复研究所聘任。　　 　
 
     数据恢复研究所实行实验室主任的全面负责制。主任应对实验室科学研究、学术交流、财务管理、专兼职人员聘任、研究生教育、实验室资产、行政后勤、安全卫生等实行统一管理。研究所内一切重大事宜均须经研究所主任或主管副主任同意方可实施。 

    数据恢复研究所实验施行主任下的全面负责制度，研究所下再设课题组, 每个专项的课题组下设1名课题组组长，其职责是管理课题组的日常运作。

    根据《国家重点实验室建设管理暂行办法》的有关规定，研究所主任基金在运行补助费中列支，由研究所主任管理，主要用于支持具有创新思想的课题、新研究方向的启动和优秀年轻人才的培养。

    数据恢复研究所还下设秘书和主任助理各一名, 协助主任、副主任等处理日常事务。

    本实验室设立学术委员会，负责审议研究所的研究方向、课题指南、基金评定以及其它重大学术事宜。

    为了保证各项重大决策的科学化、民主化和规范化，特设立主任负责制下的室务委员会。